كنيسة القديس ثيودور هي كنيسة أرثوذكسية تاريخية تقع في قلعة بيرات في مدينة بيرات، ألبانيا. يعود تاريخ بناء الكنيسة إلى القرن السادس عشر الميلادي. تتميز الكنيسة برسوماتها الجدارية التي نفذها الرسام الألباني الشهير أونفري. تم إدراج الكنيسة في قائمة اليونسكو للتراث العالمي في عام 2005 كجزء من المركزين التاريخيين لبيرات وجيروكاسترا.