مسجد كوجا مصطفى باشا هو مسجد تاريخي يقع في مدينة إسطنبول، تركيا. لقد كان المسجد في الماضي عبارة عن كنيسة أرثوذكسية من العهد البيزنطي مكرسة للقديس أندرو كريت. تم تحويل الكنيسة إلى مسجد بين عامي 1486 و 1491 م وذلك على يد كوجا مصطفى باشا، وهو سياسي عثماني شغل منصب الصدر الأعظم بين عامي 1511 و 1512.