المسجد الأعظم في شفشاون هو مسجد تاريخي يقع في مدينة شفشاون التابعة لجهة طنجة تطوان الحسيمة في شمال المغرب. يعود تاريخ بناء المسجد إلى القرن الخامس عشر الميلادي خلال فترة تأسيس مدينة شفشاون المغربية على يد أبو الحسن علي بن راشد العلمي وهو من أشراف الأدارسة. وفي رواية أخرى يعود تاريخ التأسيس إلى القرن السادس عشر الميلادي. يتميز المسجد بمئذنته المثمنة الأضلاع، وقد تم تجديده عدة مرات في الفترات اللاحقة آخرها كان عام 2006.