كنيسة القديس فرنسيس الأسيزي هي كنيسة كاثوليكية تاريخية تقع في مدينة عدن، اليمن. كانت الكنيسة مقراً للنيابة الرسولية الرومانية الكاثوليكية لجنوب شبه الجزيرة العربية بين عامي 1892 و 1974، قبل أن تنتقل إلى المقر الجديد في كاتدرائية القديس يوسف في أبو ظبي، الإمارات العربية المتحدة. هُجرت الكنيسة بعد ذلك وتعرضت لبعض الأضرار على مر السنين.